Цирроз печени и гепатит С
Вирусом гепатита С (HCV) болеют более 120 млн. человек во всем мире [1], причем заболевание ведет к циррозу печени примерно в 22% случаях в течение 20 лет. В силу вариабельности клиники заболевания, ограниченных в успехе лечения и доступности препаратов, жизненно необходимо наличие методов предсказания прогрессии болезни для своевременного и более успешного лечения. Некоторые факторы, такие как условия проживания, мужской пол, пожилой возраст инфицирования, ожирение и наличие других инфекционных заболеваний, например, вируса гепатита B (HBV) или ВИЧ, негативно сказываются на прогнозе.
В последние годы за рубежом для поиска генетических маркеров заболеваний стал активно использоваться метод геномного сканирования. В ходе таких исследований анализируется большое число полиморфизмов, находящихся в разных участках генома и имеющих достаточно высокую частоту минорного аллеля и, в большинстве своем, выбранных вне зависимости от их предполагаемой функциональной значимости. Другой особенностью таких исследований является значительная численность анализируемых групп пациентов. Одной из таких работ является исследование проведенное в 2006 году в нескольких крупных медицинских центрах США, в ходе которого был осуществлен поиск полиморфизмов, способных предсказать риск развития цирроза у пациентов с хроническим гепатитом С [2]. В ходе этого исследования была проанализирована выборка из 1468 пациентов с циррозом печени, обусловленном HCV инфекцией. Суммарно было проанализировано 24823 нуклеотидных полиморфизма.
В ходе исследования данные по частотам каждого полиморфизма многократно перепроверялись, затем они были отсортированы по значимости. Данные нескольких полиморфизмов, показавших максимальную значимость, были обработаны с помощью алгоритма наивного Байеса, позволяющего учесть суммарную роль найденных полиморфизмов в развитии цирроза печени.
В итоге в конечную панель вошло 7 полиморфизмов (Таблица 1).
Ген (хромосома) | Генотип риска | Частота у европейцев |
AZIN1 (Chr8) | GG | 86.9% |
TLR4 (Chr9) | CC | 87.3% |
TRPM5 (Chr11) | CT,CC | 63.6% |
AP3S2 (Chr15) | AG,AA | 41.6% |
NVL (Chr1) | GG | 72.3% |
STXBP5L (Chr3) | AG,AA | 18.5% |
AQP2 (Chr12) | GG | 66.7% |
Все семь полиморфизмов строго ассоциированы с повышенным риском цирроза, с OR от 1,86 до 3,23. Частота генотипов риска этих полиморфизмов также является достаточно высокой (18,5–87,3%), подтверждая, что совместный учет рисков от каждого полиморфизма позволит более достоверно оценить конечный риск цирроза. Также были учтены, в соответствие с другими исследованиями [3], другие факторы риска, такие как мужской пол, позднее инфицирование и суточный прием алкоголя. Достоверно значимым фактором оказался лишь мужской пол (OR = 1.94).
Список литературы
1. Shepard CW, Finelli L, Alter MJ. Global epidemiology of hepatitis C virus infection. Lancet Infect Dis 2005;5:558-567.
2. Hongjin Huang, Mitchell L. Shiffman, Ramsey C. Cheung, Thomas J. Layden, Scott Friedman, Olivia T. Abar, Linda Yee, Anand P. Chokkalingam, Steven J. Schrodi, Jason Chan, Joseph J. Catanese, Diane U. Leong, David Ross, Xiaolan Hu, Alexander Monto, Linda B. Mcallister, Samuel Broder, Thomas White, John J. Sninsky, and Teresa L. Wright. Identification of Two Gene Variants Associated With Risk of Advanced Fibrosis in Patients With Chronic Hepatitis C. Gastroenterology 2006;130:1679–1687.
3. Poynard T, Bedossa P, Opolon P. Natural history of liver fibrosis progression in patients with chronic hepatitis C. The OBSVIRC, METAVIR, CLINIVIR, and DOSVIRC groups. Lancet 1997;349:825-32.