О Компании
Компания «ПИННИ» («Постгеномные и нанотехнологические инновации») создана в 2003 году. Основное направление деятельности - разработка и внедрение новых технологий в области медицинской генетической диагностики и молекулярной биологии.

Колоректальный рак

Физиология и генетика. Колоректальный рак - рак толстой и прямой кишок - второй по частоте встречаемости в развитых странах, а также одна из частых причин смертельного исхода среди онкологических заболеваний. Высокая смертность связана, прежде всего, с тем, что на ранних этапах развития заболевания практически отсутствуют какие-либо симптомы. Прежде всего, в группу риска входят люди, которые имеют семейные случаи колоректального рака. Также важными факторами развития болезни являются возраст, питание и малоподвижный образ жизни.

 

Показания к анализу. Колоректальный рак.

 

Клинические данные.

CRAC1 (локус 1 аденомы и карциномы колоректального рака). E. Jaeger et.al. исследовали влияние локуса CRAC1 на развитие колоректального рака [Nature, 2008; 18084292]. Данный локус содержит следующие гены: SCG5, GREM1 и FMN1. Ученые предположили, что локус CRAC1 содержит вариабельные участки, которые влияют на увеличение риска развития колоректального рака (КРР). В исследовании принимали участие представители европейских популяций, 718 человек с семейными случаями КРР и 960 человек в качестве контроля. Детекция полиморфных участков осуществлялась на чипах Illumina Hap300 tagSNP. В результате исследования была выявлена достоверная ассоциация КРР с полиморфизмом C>T (OR = 1,35; P < 0,001, 95% confidence interval (CI) = 1.14–1.60).

 

Локус 8q24. Ch.A. Haiman et.al. исследовали вклад локуса 8q24 в развитие КРР. В исследовании приняли участие представители различных популяций численностью 1807 человек с диагнозом КРР и 5511 человек в качестве контроля. Для представителей европейской популяции была выявлена достоверная связь полиморфизма T>G с риском развития КРР (OR = 1,28).

 

EIF3H (эукариотический фактор 3 инициации трансляции). Для идентификации генетических маркеров КРР I.Tomlinson et.al. провели полногеномное исследование (GWAS). На первой стадии исследования было проанализировано 550 163 точечных полиморфизмов у 1940 пациентов с семейными случаями КРР и у 965 человек контроля. На второй стадии исследования было проанализировано 42 708 SNP у 2873 пациентов с диагнозом КРР и у 2871 человек контроля. Все испытуемые европейского происхождения. В результате статистического анализа была показана достоверная связь полиморфизма A>C с риском развития заболевания (ORhet (гетерозигота) = 1,27, ORhom (гомозигота) = 1,43).

 

SMAD7. P.Broderick et.al. исследовали влияние гена SMAD7 на риск развития КРР (GWAS). Было проанализировано 550 163 SNP у 940 пациентов с семейными случаями КРР и у 965 контроля. Детекция полиморфных участков осуществлялась на чипах Illumina Hap550 BeadChips. В результате было выделено 3 SNP гена SMAD7, наиболее достоверную ассоциацию из которых показал полиморфизм C>T, причем полиморфизм носит протективный характер (P < 0,001, ORhom = 0,73, ORhet = 0,86)

 

Локус 11q23. A.Tenesa et.al. провели полногеномное исследование (GWAS), чтобы идентифицировать полиморфные участки в локусах 11q23 и 8q24, влияющие на развитие КРР. В первой фазе исследования было проанализировано 555 510 SNP у 1012 пациентов с КРР из Шотландии и у 1012 человек контроля. Генотипирование осуществлялось с помощью чипов Illumina HumanHap300 and HumanHap240S arrays. Во второй фазе исследования было проанализировано 15 008 SNP у 2057 пациентов с КРР из Шотландии и у 2111 человек контроля. Генотипирование осуществлялось с помощью чипов Illumina iSelect platform. Результаты двух исследований показали, что полиморфизм A>C в локусе 11q23 влияет на риск развития ректального рака (прямой кишки) (OR = 1,163, P < 0,001). Эти данные подтверждены в работе A. M. Pittman et.al. A. M. Pittman et.al. проводили исследование для выявления молекулярно-генетических маркеров колоректального рака, находящихся в локусе 11q23. Ученые определили генотип по полиморфизму A>C у 10638 пациентов с диагнозом КРР и у 10457 человек контрольной группы. Исследования проводились на представителях различных европейских популяций. Была обнаружена значительная ассоциация между С аллелем и риском развития КРР (OR = 1.17; 95% confidence interval [CI]: 1.12–1.22; P = 1.08 3 10-12).

 

Сводная таблица по колоректальному раку для представителей европейских популяций:

 

N

Название гена/локуса

Сокр.

Полиморфизм

OR минорного аллеля

ORhet

(гетерозигота)

ORhom

(гомозигота)

1

Локус 8q24

8q24

T>G

1,28

 

 

2

SMAD family member 7

SMAD7

C>T

 

0,73

0,86

3

Ген колоректальной аденомы и карциномы 1

CRAC1

C>T

1,35

 

 

4

Локус 11q23

11q23

A>C

1,17

 

 

5

Эукариотический фактор 3 инициации трансляции

EIF3H

A>C

 

1,27

1,43

 

© 2003-2014 «Постгеномные и нанотехнологические инновации»