О Компании
Компания «ПИННИ» («Постгеномные и нанотехнологические инновации») создана в 2003 году. Основное направление деятельности - разработка и внедрение новых технологий в области медицинской генетической диагностики и молекулярной биологии.

Рак предстательной железы

Физиология и генетика. Рак предстательной железы (РПЖ) - наиболее распространенная злокачественная опухоль у мужчин. С возрастом риск данного заболевания увеличивается: у мужчин моложе 40 лет - 1 на 10 000; в возрасте 60 лет - 1 на 100; в возрасте 75 лет - 1 на 8 человек.

 Показания к анализу. Рак предстательной железы.

 Клинические данные.

J. Gudmundsson et.al. проводили полногеномное исследование (GWAS) для определения влияния локуса 8q24 на риск развития рака предстательной железы у представителей европейской популяции (Исландия). Были проанализированы генотипы у 1453 человек с диагнозом РПЖ и у 3064 человек контрольной группы. Результаты работы для европейской популяции приведены в таблице:

 

N

Название гена/локуса

Аллель риска

OR (аллель риска)

P value

1

Локус 8q24_Rl

A

1,71

< 0,001

2

Локус 8q24_R2

A

1,8

< 0,001

 Ch. A Haiman et.al. проводили полногеномные исследования в пяти различных популяциях. В работе анализировалось 2973 SNP у 7518 человек с диагнозом РПЖ и у группы контроля (афроамериканцы – 1614/837, азиаты- 722/728, гавайцы – 111/112, латиноамериканцы – 637/633, евроамериканцы – 1182/942). Была обнаружена достоверная связь между полиморфизмом T>G и риском развития РПЖ (OR (евроамериканцев) = 1,13, OR (афроамериканцев) = 1,43, в среднем для всех популяций без учета других маркеров OR = 1,18, P < 0,001).

 M. Yeager et.al. проводили полногеномное исследование на представителях европейской популяции. Поиск молекулярно-генетических маркеров осуществлялся в пределах локуса 8q24. Выборка состояла из 1172 человек с диагнозом РПЖ и 1157 человек контроля (PLCO). Данные по результатам исследований приведены в таблицах. Результаты исследования для европейской популяции показаны в таблице:

 

N

Название гена/локуса

Аллель риска

OR het

OR hom

P value

1

Локус 8q24_Rl

A

1,42

2,78

< 0,001

2

Локус 8q24_R3

G

1,40

1,73

< 0,001

 

G. Thomas et.al. продолжили полногеномное исследование (GWAS) для определения других локусов, отвечающих за развитие рака простаты. В первом исследовании ими было проанализировано 527 869 SNP у 1172 пациентов с РПЖ и у 1157 европейцев из контрольной группы. В следующем исследовании было проанализировано 26 958 SNP у 4020 пациентов и у 4028 контроля различных популяций. Кроме того, пациенты были разбиты на две группы: с агрессивной формой РПЖ и неагрессивной. Данные были собраны из четырех независимых выборок. Генотипирование осуществлялось на специально разработанных чипах iSelect Infinium assay (Illumina). Результаты исследования приведены в таблице:

 

N

Название гена/локуса

Аллель риска

Неарессивная форма

Агрессивная форма

P value

OR het

OR hom

OR het

OR hom

1

С-концевой связывающий белок 2

C

1,20

1,63

1,17

1,46

< 0,001

 J. Gudmundsson et.al. провели полногеномное исследование представителей европейской популяции (Исландия). Выборка состояла из 1501 пациентов с РПЖ и 11 290 человек контроля. Для генотипирования использовали чипы Illumina Hap300. В результате обработки данных было выявлено два полиморфизма, находящихся в 17 хромосоме и связанных с риском развития РПЖ: G>A и T>G. Результаты исследования для представителей европейской популяции приведены в таблице:

 

N

Название гена/локуса

Аллель риска

OR het

OR hom

P value

1

Локус 17ql2-TCF2

A

1,12

1,40

< 0,001

2

Локус 17q24.3

G

1,35

1,33

< 0,001

 J. Gudmundsson et.al. используя результаты полногеномного исследования, выявили ассоциацию полиморфизма A>G с риском развития РПЖ (OR = 1,13). Исследуемая выборка состояла из 1725 пациентов с диагнозом РПЖ и 35392 человек контроля. Для генотипирования использовали чипы Illumina 317K.

 S. L. Zheng et.al. исследовали влияние полиморфных участков в локусе 11q13 на риск развития РПЖ. Выборка состояла из представителей европейской популяции (Швеция), в которую входили 2899 пациентов с РПЖ и 1722 человека контроля. В качестве кандидатных было выбрано 11 SNP из данного локуса. В результате была показана достоверная связь между полиморфизмом A>G и риском развития РПЖ (OR het = 1,16, OR hom = 1,42, P < 0,001).

 J. Gudmundsson et.al. использовали полногеномные исследования рака простаты у 22918 исландцев (1854 больных и 21064 человека контроля), а также 15500 индивидуумов из Европы и США. Была показана связь полиморфизма G>A с риском развития РПЖ. Данные исследований приведены в таблице:

 

Название гена/локуса

Аллель риска

OR (аллель риска) для европейской популяции

OR (аллель риска) для популяций Европы и США

Локус 2pl5

A

1,16 (P < 0,001)

1,15 (P < 0,001)

 

Сводная таблица по раку предстательной железы у представителей различных европейских популяций:

N

Название гена/локуса

Сокр.

Полиморфизм

OR минорного аллеля

OR het

OR hom

1

Локус 8q24_Rl

8q24_Rl

C>A

1,6

1,43

2,23

2

Локус 8q24_R3

8q24_R3

T>G

 

1,26

1,58

3

Локус 8q24_R2

8q24_R2

C>A

1,79

 

 

4

Локус 17q24.3

17q24.3

T>G

 

1,33

1,45

5

Локус 17ql2-TCF2

17q12-TCF2

G>A

 

1,23

1,48

6

Локус Ilql3

11ql3

A>G

 

1,16

1,42

7

Локус 2pl5

2pl5

G>A

1,16

 

 

8

С-концевой связывающий белок 2

CTBP2

T>C

 

1,2 (1,17)

1,63 (1,46)

9

Локус JAZF1

JAZF1

A>G

1,13

 

 


© 2003-2014 «Постгеномные и нанотехнологические инновации»